Τις εργασίες της συνέχισε στις 3 Φεβρουαρίου 2013 η Ιερά Σύνοδος της Ιεραρχίας της Ορθοδόξου Εκκλησίας της Ρωσίας. Των εργασιών προηγήθηκε η εναρκτήρια ομιλία του Αγιωτάτου Πατριάρχου Μόσχας και Πασών των Ρωσιών Κυρίλλου.

Σε ανακοινώσεις περί του έργου της ομάδας εργασίας για την κατάρτιση της κατηχήσεως της Ορθοδόξου Εκκλησίας της Ρωσίας και των θεμάτων της διορθόδοξης συνεργασίας και του διαλόγου Ορθοδόξων και Ρωμαιοκαθολικών προέβη ο Μητροπολίτης Βολοκολάμσκ Ιλαρίωνας, Πρόεεδρος του Τμήματος Εξωτερικών Εκκλησιαστικών Σχέσεων του Πατριαρχείου Μόσχας.

Εν συνεχείᾳ συζητήθηκαν θέματα, τα οποία έγειρε στην ομιλία του κατά την πρώτη συνεδρίαση της ολομέλειας στις 2 Φεβρουαρίου ο Αγιώτατος Πατριάρχης Μόσχας και Πασών των Ρωσιών Κύριλλος.

Το επόμενο σημείο της ημερήσιας διατάξεως ήταν η συζήτηση του θέματος περί συνθέσεως του Εκκλησιαστικούς Δικαστηρίου της Ρωσικής Εκκλησίας. Ο Αγιώτατος Πατριάρχης εξήρε το έργο της παρούσης συνθέσεως του δικαστηρίου και πρότεινε την ανανέωση του έργου του έως την επόμενη Σύνοδο της Ιεραρχίας.  Η πρόταση έγινε ομοθυμαδόν δεκτή.

Ο Γραμματέας της Συνόδου, Πρωτοσύγκελος του Πατριαρχείου Μόσχας Μητροπολίτης Σαράνσκ και Μορδοβίας Βαρσανούφιος ανακοίνωσε τις επιλογές της διαδικασίας εκλογής του Πατριάρχου Μόσχας και Πασών των Ρωσιών. Όπως είναι γνωστόν στα πλαίσια της Διασυνοδικής Επιτροπής επεξεργάσθη και παρεπέμφθη στην Ιερά Σύνοδο της Ιεραρχίας τέσσερις επιλογές, όπου εκτίθεται η σχετική διαδικασία.

Το σώμα ομοθυμαδόν αποφάσισε την κλειστή ψηφοφορία του κανονισμού εκλογής του Προκαθημένου της Ορθοδόξου Εκκλησίας της Ρωσίας. Ληξάσης της ψηφοφορίας ο Πρόεδρος της Επιτροπής Καταμέτρησης Μητροπολίτης Τερνόπολ και Κρεμενέτς Σέργιος ανακοίνωσε τα αποτελέσματα, σύμφωνα με τα οποία η πλειοψηφία των ψηφοφόρων στήριξαν την ισχύσουσα διαδικασία εκλογής του Πατριάρχου Μόσχας και Πασών των Ρωσιών.

Ο Μητροπολίτης Βαρσανούφιος ενημέρωσε το σώμα για τις εισηγήσεις τροποποιήσεων στον Καταστατικό της Ορθοδόξου Εκκλησίας της Ρωσίας. Ακολούθησε η συζήτηση αυτών.

Οι Ιεράρχες επίσης συζήτησαν το σχέδιο του Κανονισμού συνθέσεως της Τοπικής Κληρικολαϊκής Συνόδου της Ορθοδόξου Εκκλησίας της Ρωσίας.

Οι τροποποιήσεις στον Καταστασικό της Ορθοδόξου Εκκλησίας της Ρωσίας και ο Κανονισμός συνθέσεως της Τοπικής Κληρικολαϊκής Συνόδου της Ορθοδόξου Εκκλησίας της Ρωσίας μετά από συζήτηση έγιναν δεκτοί ομοθυμαδόν.