Σε πρώτη της συνεδρίαση της χειμερινής περιόδου (Σεπτέμβριος 2012 – Φεβρουάριος 2013) συνήλθε στις 4 Οκτωβρίου 2012 προεδρεύοντος του Αγιωτάτου Πατριάρχου Μόσχας και Πασών των Ρωσιών Κυρίλλου η Ιερά Σύνοδος της Ορθοδόξου Εκκλησίας της Ρωσίας.

Η Ιερά Σύνοδος ενέκρινε τα αποτελέσματα των Πρωθιεραρχικών επισκέψεων του Πατριάρχου Κυρίλλου στην Πολωνία και την Ιαπωνία, στην Ουκρανία και στις επαρχίες εντός Ρωσίας, επισημαίνοντας την «ιστορική σημασία του Κοινού Μηνύματος προς τους λαούς Ρωσίας και Πολωνίας, διά του οποίου τοποθετείται θεμέλιο διά το διάλογο και τη συνεργασία μεταξύ των λαών Ρωσίας και Πολωνίας».

Ελήφθησαν αποφάσεις σχετικά με την πλήρωση και τη σύσταση νέων επαρχιών καθώς και την ανύψωση σε Μητρόπολη της επαρχίας Βιάτκας.

Η Ιερά Σύνοδος υπενθύμισε στους Ιεράρχες, τους κληρικούς, τους μοναχούς και τα στελέχη των κεντρκών ιδρυμάτων της Εκκλησίας  την ανάγκη της παντοτινής εφαρμογής των αποφάσεων των Ιερών Συνόδων της Ιεραρχίας και της Διαρκούς Ιεράς Συνόδου, σύμφωνα με τις οποίες απογορεύεται στους Ιεράρχες ή κληρικούς να εκλεγούν σε οποιοδήποτε όργανο της αντιπροσωπευτικής αρχής οποιασδήποτε χώρας και σε οποιοδήποτε επίπεδο καθώς και να είναι μέλη πολιτικών κομμάτων ή να καταλάβουν οποιεσδήποτε θέσεις στην κομματική ιεραρχία. Εξαιρούνται οι περιπτώσεις της «άκρας ανάγκης διά την Εκκλησία, όταν επιβάλλεται η αντίσταση στις σχισματικές ή ετερόδοξες και ετερόθρησκες δυνάμεις, οι οποίες επιδιώκουν την εκμετάλλευση της εξουσίας διά να μάχονται κατά της Ορθοδόξου Εκκλησίας» και μόνο με την ευλογία της Ιεράς Συνόδου ή της Συνόδου της Αυτοδιοίκητης Εκκλησίας.

Επίσης η Ιερά Σύνοδος μελέτησε θέματα της εξωτερικής εκκλησιαστικής δράσεως και ενέκρινε ακολουθία του Αγίου Ομολογητού Αθανασίου, Επισκόπου Κοβρώφ καθώς και την ακολουθία για χειροθεσία κωδωνοκρούστη. Τέλος η Σύνοδος ασχολήθηκε με θέματα στελεχώσεως των Ιερών Μονών στις επαρχίες της Ρωσικής Εκκλησίας και των ιδρυμάτων εξωτερικού.