Το νεκροταφείο Γιανάκα στο Τόκιο, όπου ετάφη ο Άγιος και Ισαπόστολος Νικόλαος Ιαπωνίας, επισκέφθηκε στις 16 Σεπτεμβρίου 2012 ο Αγιώτατος Πατριάρχης Μόσχας και Πασών των Ρωσιών Κύριλλος στα πλαίσια της ποιμαντικής του επισκέψεως προς την Ιαπωνία. Εκεί ο Ρώσος Προκαθήμενος τέλεσε δοξολογία προς τιμήν του Αγίου Φωτιστή της Ιαπωνίας.

Εν συνεχείᾳ ο Αγιώτατος Πατριάρχης Κύριλλος τέλεσε Ιερό Τρισάγιο υπέρ αναπαύσεως των ψυχών των κεκοιμημένων Ιεραρχών της Ορθοδόξου Εκκλησίας, οι οποίοι ετάφησαν επίσης εδώ. Ανάμεσά τους είναι οι Μητροπολίτες Σέργιος Τιχομίρωφ (1871 — 1945) και Θεοδόσιος Ναγκασίμα (1935-1999) καθώς και ο Επίσκοπος Νικόλαος Όνο  (1872-1956). Επίσης προσευχήθηκε για άλλους Ιεράρχες οι οποίοι υπηρέτησαν στην Ιαπωνία τον 20 αιώνα.

Σημειωτέον ότι στην ακολουθία παρέστησαν οι Μητροπολίτες: Τόκιο και Πάσης Ιαπωνίας Δανιήλ, Σαράνσκ και Μορδοβίας Βαρσανούφιος, Πρωτοσύγκελος του Πατριαρχείου Μόσχας, Βολοκολάμσκ Ιλαρίωνας, Πρόεδρος του Τμήματος Εξωτερικών Εκκλησιαστικών Σχέσεων του Πατριαρχείου Μόσχας, οι Αρχιεπίσκοποι: Ρόβνο και Οστρόγκ Βαρθολομαίος, Σενταΐ Σεραφείμ, ο Επίσκοπος Σολνετσνογκόρσκ Σέργιος, Διευθυντής της Διοικητικής Γραμματείας του Πατριαρχείου Μόσχας, ο πρωθιερέας Νικόλαος Μπαλασώφ, Αναπληρωτής Πρόεδρος του ΤΕΕΣ, ο πρωθιερέας Νικόλαος Κοτσιουμπάν, Προϊστάμενος του Μετοχίου της Ορθοδόξου Εκκλησίας της Ρωσίας στο Τόκιο, Ιάπωνες κληρικοί, ο πρωτοδιάκονος Βλαδίμηρος Ναζάρκιν, βοηθός του Προέδρου του ΤΕΕΣ.

Επίσης παρέστησαν προσευχόμνεοι ο κ. Β. Λεγκοϊντα, Πρόεδρος του Συνοδικού Τμήματος Πληροφοριών του Πατριαρχείου Μόσχας και άλλοι.